A Coleção se encontra em uma sala localizada no Bloco III, 1º andar do Centro de Ciências Sociais e Educação (CCSE) na Trav. Djalma Dutra s/n, bairro do Telégrafo. O espaço encontra-se dividido em duas partes: a primeira parte administrativa com a presença de dois computadores, três mesas, uma impressora e um ar-condicionado. Já a segunda parte é o local onde fica depositado todo o material zoológico da coleção, com material preservado em meio seco e líquido. Neste espaço encontram-se mesas de estudo e de trabalho taxonômico, armários entomológicos e armário para material de expediente para uso em coleções, estantes de metal com material preservado em meio líquido. Esta sala do acervo é refrigerada e mantém, com o apoio de desumidificador, o ambiente adequado (temperatura e umidade) para preservação do material zoológico.
Ao lado do Bloco III, no térreo, também se encontra um anexo da coleção que é utilizado para o tratamento e preparação do material zoológico que irá ser incrementado ao acervo. Também, neste espaço é realizada a manutenção de todo o material zoológico, como as medidas de controle de pragas de acervo, bem como de medidas preventivas. Este espaço também é utilizado pelos estagiários e bolsistas da coleção para estudos e desenvolvimento de atividades e treinamentos em métodos de coleta e preservação de material zoológico, além de técnicas de curadoria, sob supervisão e orientação dos pesquisadores da Coleção.